Clostridium difficile: réémergence du potentiel zoonotique

L’article de Gould et Limbago passe en revue les découvertes récentes sur le C difficile chez les animaux et les aliments et traite de toutes les questions majeures associées à ce sujet. Ces questions comprennent le chevauchement des types présents chez les humains et les animaux, des aspects qualitatifs et quantitatifs du C difficile dans les aliments, et du type de données dont nous avons encore besoin pour confirmer la transmission zoonotique et alimentaire du C difficileIt est maintenant évident que le C difficile est aussi symptomatique. comme des animaux asymptomatiques; En outre, et contrairement à la situation chez l’homme, les résultats des tests de toxine commerciale dans les échantillons fécaux animaux sont souvent faiblement corrélés avec les résultats de la culture. Différents animaux, tels que la volaille, plus adapté au C difficile que les autres et servent uniquement d’hôtes multiplicateurs Ceci est possible, car un seul élevage de porcs est généralement associé à des ribotypes de PCR en chaîne, alors que nous avons trouvé des ribotypes de PCR sur un seul élevage de volaille. Gould et Limbago discutent d’abord des difficultés concernant la comparabilité des techniques de typage. En effet, mauvaise comparabilité des résultats obtenus avec différentes méthodes de typage, par exemple, électrophorèse en champ pulsé vs ribotypage par PCR et même médiocre comparabilité. des résultats d’une méthode unique parmi diverses études Le ribotypage PCR affecte significativement notre compréhension de l’écologie du C difficile Même si nous gardons à l’esprit la possible mauvaise interprétation des résultats et la faible comparabilité entre les études, les preuves montrent que le chevauchement entre les réservoirs animaux et humains était modeste dans le passé mais a augmenté au cours des dernières années. La toxine en plus des toxines A et B étaient plus souvent isolées chez les animaux% -% de tous les isolats, selon les espèces, alors qu’elles étaient rares chez les humains habituellement jusqu’à% Actuellement, les ribotypes presque PCR sont connus chez les humains, mais seulement ont été détectés chez les animaux Comme les études sur différents animaux continuent, le nombre de souches et, par conséquent, le nombre de génotypes associés aux animaux augmentera, et nous apprendrons que le chevauchement des types de C difficile entre les humains et les animaux est beaucoup plus grand Beaucoup d’attention a été consacrée récemment au ribotype de la PCR, et il y a une certaine spéculation que c’est un nouveau type émergent associé à une virulence accrue pour les humains et un exemple de transmission du C difficile des animaux aux humains En effet, le génotype était le type le plus répandu chez de nombreux animaux veaux, porcs et chevaux dans plusieurs pays au Canada, aux États-Unis et aux Pays-Bas, alors qu’il était extrêmement rare. Cependant, il est important de comprendre que, comme chez les humains, le génotype prédominant chez les animaux diffère d’un pays à l’autre. Par exemple, nos données de Slovénie démontrent que le ribotype PCR est absent chez différents animaux de ferme, mais d’autres apparentés et non apparentés prurit. Les ribotypes de PCR, SI sont présents. En ce qui concerne la nourriture étant l’un des vecteurs possibles entre les animaux et les humains ou vice versa, de nombreuses questions demeurent. Comme discuté par Gould et Limbago , un nombre limité d’études peuvent être résumées. C difficile de la nourriture nécessite des étapes d’enrichissement, indiquant que les nombres bactériens sont faibles Deuxièmement, le pourcentage d’échantillons positifs varie considérablement du pays t o pays Alors que% -% d’échantillons sont positifs en Amérique du Nord, les données pour les pays européens indiquent que le taux d’échantillons positifs est <%> La raison la plus évidente de cette disparité est la différence entre les techniques d’abattage L’Europe, mais la mesure dans laquelle l’abattage contribue à la contamination alimentaire n’est pas claire Une seule étude sur le C difficile chez les animaux avant l’abattage en Autriche a trouvé C difficile dans les excréments de vaches%, cochons% et poulets% Il est possible que C difficile a toujours été et est toujours présent dans le microbiote intestinal des jeunes animaux et des jeunes humains. De ce réservoir primaire, il peut être distribué par contact, excrétion, ou consommation alimentaire. Depuis l’introduction d’antibiotiques à large spectre et activité anti-anaérobie par exemple, clyndamycine, le C difficile s’est établi dans les hôpitaux. Cependant, il est également resté présent dans d’autres réservoirs, qui sont peut-être moins étudiés, et à des niveaux subdétectables Altho Si l’on ne dispose pas de données publiées, on pourrait supposer qu’avec une modification de la pression sélective, comme la modification des politiques antibiotiques en production animale, la présence de C difficile chez les animaux a augmenté de telle sorte que le chevauchement entre humains et animaux est beaucoup plus probable. il semble que nous ayons une occasion unique d’observer l’évolution de la réémergence de certains réservoirs de Clostridium difficile

Remerciements

Soutien financier ARRS subvention J– et septième programme-cadre de la Communauté européenne FP / -, dans le cadre de la convention de subvention n Conflits d’intérêts potentiels MR: no conflicts